• Подготовка высококвалифицированных специалистов для науки, образования и производства;
• проведение фундаментальных, поисковых и прикладных научных исследований по решению проблем химии макрогетероциклических соединений и смежных областей;
• внедрение и коммерциализация результатов НИР в производство и учебный процесс;
• подготовка кандидатов и докторов наук в процессе научных исследований, а также через аспирантуру и докторантуру;
• повышение квалификации сотрудников Института;
• организация и проведение научных конференций, семинаров, школ, конкурсов;
• участие в международных, федеральных и ведомственных научно-технических программах;
• экспертная деятельность научно-исследовательских работ в области химии макрогетероциклических соединений;
• издательская деятельность;
• распространение научных знаний и повышение культурно-образовательного уровня населения.

Развитие новых актуальных направлений химии макрогетероциклических соединений нуждается в объединении усилий синтетиков, физико-химиков, теоретиков и других специалистов. В этом и состоит миссия Института МГЦС, основные научные направления деятельности которого связаны с проведением фундаментальных, поисковых и прикладных научных исследований по решению проблем химии макрогетероциклических соединений и смежных областей, включая направленный синтез и систематические исследования макрогетероциклических соединений и создание перспективных функциональных соединений на их основе.

Коллектив Института МГЦС базируется на участниках ведущей научной школы (НШ-2642.2008.3) «Химия макрогетероциклических соединений на основе порфиринов и их аналогов. Направленный синтез новых материалов» (руководитель – О.И. Койфман).

1. Отдел молекулярного дизайна и направленной функционализации макрогетероциклических соединений (руководитель – чл.-корр. РАН О.И. Койфман).

• Лаборатория синтеза порфиринов
• Лаборатория синтеза и исследования порфиразиноидов
• Лаборатория синтеза фталоцианинов
• Лаборатория синтеза родственных макрогетероциклов
• Лаборатория супрамолекулярной химии

2. Отдел физической и координационной химии макрогетероциклических соединений (руководитель – д.х.н. О.А. Голубчиков).

• Лаборатория координационной химии порфиринов и родственных соединений
• Лаборатория физических методов исследования и квантово-химических расчетов
• Лаборатория электрохимии
• Лаборатория химии неплоских аналогов порфиринов

3. Отдел новых функциональных материалов на основе макрогетероциклических соединений и родственных соединений (руководитель – к.х.н. Т.А. Агеева).

• Лаборатория полимерных материалов
• Лаборатория катализа
• Лаборатория технологии Ленгмюра-Блоджетт
• Лаборатория супрамолекулярных и жидкокристаллических систем

4. Международная научно-исследовательская лаборатория IRLоN (руководитель – проф. Томас Торрес, Испания).

5. Научно-производственная лаборатория «Хлорин» (руководитель – М.О. Койфман).